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跨时代的一夜结束了。
当其余大国反应过来时，才骤然发现，一夜之间木叶的实力竟然大损。
宇智波一族半数离开木叶，最重要的是，连同宇智波斑和宇智波玄两人也同样离开了木叶。
三神在短短的一夜间，离开的两位。
当然，木叶村对外宣称的是宇智波斑已经死亡，在那场被命名为“终结谷之战”的战斗中死在千手柱间手下。
至于宇智波玄，没有任何消息，好像是离奇失踪了，木叶对此也颇为遮遮掩掩，让其他忍村猜测不透。
不过无论如何，木叶村实力大减是不争的事实，因此在暗地里，其他忍村产生了一些偷摸的小动作，以此来试探木叶的反应。
让他们再次跳出来和木叶宣战，他们还是不敢的，虽然木叶的实力大损，可千手柱间余威仍在，并非谁都敢去拔虎须的。
然而，在木叶中也出现了尴尬的一幕。
根据木叶村的规矩，像这种大规模的叛乱，是一定要定性的，哪怕不发布通缉令，也要将离开的宇智波一族定位叛忍。
在其中，千手扉间就认为，因该将宇智波斑和宇智波玄定义为木叶最大的叛忍，在S级之上再开出新的等级，即所谓的三S级叛忍。
可惜的是他失败了，原因很简单，根据木叶建立之初的宪章，斑和玄是最高决策层的成员，无论发生任何事，都无法被剥离最高决策层的身份。
如果连他们身份都无法否定，怎么可能把他们定义成叛忍。
这样一来，就让木叶的高层陷入了一个十分尴尬的境地，在理论上，如果未来的某一天宇智波斑或者宇智波玄回到了木叶，他们的身份依旧是木叶的最高领导层。
因为在宪章中，他们的身份就不容撼动。
这让许多长老都咬牙切齿，却又无可奈何，原因很简单，唯一能够改动宪章的千手柱间不同意这件事。
没有人知道他出于什么考虑，总之，他保留了这个看似毫无道理的最高决策层体系。
虽然其中的成员只剩他一个。
在这种情况下，其他木叶高层也只能摇头叹息，最终只能放弃。
算了，反正现在的这种情况，宇智波斑死了，宇智波玄也不可能回到村子，这个名存实亡的最高决策层是否还存在意义不大。
不过等待第二代火影时，一定不能再让这个组织出现，就让初代的最高决策层成为历史的尘埃。
无数高层心中如此想到。
木叶的重建仍在继续，许多事积压在一起，宇智波半数族人离开绝不止表面上的那些影响。
暗部整个成了空壳，无数绝密资料不翼而飞，那些带不走的器材以及实验用具则被砸了个稀巴烂。
除了其他忍族在暗部的忍者外，所有在暗部任职的宇智波族人无一留下。
之后，柱间让“根”部入主暗部，部长不再由其他任何人担任，直接由火影本人兼任。
至于原先的“根”，则取消了编制，彻底融入暗部。
然而在暗中，千手扉间并未完全按照自己大哥的命令行事，他仍抽调了一批心腹，将“根”的核心留了下来。
之后，暗部重新开始运作，但这一次，已经彻底的改头换面，并且原先的一切情报网都不能使用，必须重新开辟，这就等于一切回归原点。木叶的情报系统，短时间内成为了瞎子。
等到村子重建的差不多时候，千手柱间亲自带人去了趟原宇智波北部的信城，那里是玄起家的地方，即便是木叶建立后也还有相当数量的宇智波族人驻守。
柱间想去看看，宇智波族人是否撤到了这里，终结谷之战爆发的太突然了，让他完全来不及反应。他想见见玄，有很多话他想当面问清楚。
不过当来到信城后，他失望了，仍旧是一座繁华的城市，可所有的宇智波族人都已撤离，连一个影子都无法见到。
不甘心的柱间又亲自前往大名府，他记得，大名身边因该有玄当初留下的亲信。
火影来访，自然得到大名最高规格的接待，在这位金主面前，表面功夫还是要做一下的，于是在陪大名走完了流程后，柱间才表明自己的来意。
答案仍未出乎预料，根据大名的回答，早在半年前，宇智波的族人已经相继撤离他身边。
柱间沉默了，呆了两天后便告辞回了木叶。大名表示身边没有高手保护缺乏安全感，千手柱间也答应他，为他培养专门的高手随身保护，被命名为守护十二士。
……
离开木叶的宇智波就好像人间蒸发了一样，任由千手柱间怎么寻找，也无法发现蛛丝马迹。
再加上暗部刚刚完成重组，情报能力有限，柱间只好把这件事令当做一条长期命令下达，希望有一天能够发现离开宇智波的踪迹。
之后，千手柱间便全身心的投入火影的工作中。
在村子重建后不久，有一条喜讯传出，千手柱间的妻子，漩涡水铃生下了一个男孩。
整个木叶村因为这件事喜庆连连，千手一族更是张灯结彩。就连千手柱间的脸上也露出了久违的笑容。
这个孩子被千手柱间取名为千手沪深。千手扉间更是对这个侄子无比喜爱。
然而，相比于喜庆的木叶村，火之国另一处所在就显的冷清许多。 在一片云雾缭绕的山谷中，简陋的村落构架浮现眼前，玄推开一扇门走入，玩笑道：“柱间的儿子出世了，你这个当大伯的不准备送份礼物么？” ....