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元宵节之后，皇帝出行去巡视京城外的兵工厂。
讲实话，虽然数理院已经研究出了大明自产的燧发枪。但是这种枪的射击速度还是太慢了，目前京军正在使用的还是前装的燧发枪，其点火装置是摩擦燧石。一个训练有素的士兵可以一分钟射击四次，三段式射击配合轻型火炮的碎片杀伤可以组成较大的火力。
相比于弓箭来说，这种射击速度有些慢。但是子弹的穿透力远远超过弓箭，而且一位弓箭手顶多连续发弓十次，十次射箭以后就会脱力，失去作战能力。而一位火枪手训练时间较短，却能够连续射击不停。对于这种精细的枪械，朱由校心里清楚不能操之过急，需要这些科研人员慢慢发明。
目前来讲，火器研究的最大瓶颈在重型火炮上。数理院仿制红夷大炮的明朝本土重型火炮屡屡出问题，不是炸膛就是太过笨重，生产制造毫无进展。朱由校就是为了此事再次来到兵工厂了解情况，排除弊端。
在兵工厂里有一大批工人干得热火朝天、浑身大汗，他们干活的热情主要是来自优厚的月钱。皇帝先是看了看新完工的重型火炮，然后再去视察烟熏火燎的高炉，最后数理院的副院长王徵陪着天子到他的书房去休息。
其实数理院的这些火器制造专家们已经做出改革了，炮架和瞄准器具都得到了完善。炮架是调整火炮射击方向和高低夹角的器具。以前明军对此不够重视，许多火炮没有炮架，只是固定的。一些炮架只能调整高低夹角而不能左右转动，限制了射击范围。已设的炮架大多用粗劣木料制成，演放后，炮架就震松了，难以使用。在没有瞄准具的岁月里，士兵只能通过经验来瞄准。
现在的数理院已经给火炮配备上坚固且可以灵活转动的炮架。现在徐光启已经安装上了炮规，可以用来确定高低夹角。炮弹也由原来单一的实心弹转为实心弹、爆炸弹和霰弹的多种组合。在管理维护上，在皇帝的建议下，炮手会定期给火炮做保养和维修，不允许露天闲置，免得被日晒雨淋，炮身锈蚀。
不能制造重型火炮的主要原因是铁质差，冶炼的火炉温度低，铁水无法提纯，含杂质多，铸造出来的火炮十分粗糙，气孔气泡多，演放时很容易炸裂，自伤射手。
明军针对此问题主要是加厚火炮的管壁，这样火炮极为笨重，数千斤的巨炮，威力反倒不如比它轻的西方火炮。再就是对已经铸成气孔气泡较多、容易炸裂的火炮，明军则减少火药填装量，这样做再次降低了火炮的威力。
皇帝发现明朝目前还是应用落后的泥模工艺，铸件毛糙，也未对炮膛进行深入的加工，致使炮弹射出后，弹道紊乱，降低了射击精度。最关键的问题是明朝没有系统的科学知识，火药燃烧、弹道、初速度这些都属于物理学和化学内容。现在欧洲也没有什么成型的科学理论，毕竟牛顿还没有出生呢。
朱由校向王徵建议，想办法提高炼铁的炉温，用铁模来制造火炮。数理院的副院长王徵认真的听着，王副院长穿着一身布满炉灰的工作服。皇帝今日到来没有事先通知，他一点准备都没有。君臣二人聊着工厂铸造火炮的有关事宜，说到中午时分，有一位小吏来通知王徵，说是他的夫人来给他送饭。
“王徵，你的夫人可真是贤惠啊，不必顾忌朕，小吏，你叫王夫人过来即可。”朱由校笑着讲道。
打开门，一位衣着端庄朴素上年纪的妇人，手提着一个精致的食盒，走了进来。王徵的夫人得知皇帝在此，急忙向天子跪拜行礼。这位尊贵的万岁爷，叫她平身，亲切地跟她问好。王夫人很为天子的平易近人而感动，她甚至有些胆大地请求皇帝帮她做一件事。
“陛下，老妇有一件大事希望皇上能够帮忙。”
“你说说看，朕听一听。”朱由校感到有些意外，他出门在外一直都不太摆架子，由此得到了一些贤德的名声，但是一见面就直接提要求的还是挺少见的。
“老妇请求皇上下令，让我夫君纳一房小妾。”
“等一下，朕有些听不明白，你是数理院副院长王徵的夫人，对吧？”
“是的，皇上。”
“你要朕下旨让你夫君纳一房小妾？”
“对，这是我的心愿。”
“朕还是不明白，自古妻子都是不愿丈夫三妻四妾的，为何你主张丈夫纳妾呢？更何况这是你们的家事，朕怎么好下命令呢！”
一旁的王徵坐不住了，他跟皇帝讲：“陛下，臣的妻子不懂事，希望陛下不要怪罪。”
“回陛下，老妇年岁已近半百，虽然育有两个女儿，但不能为我夫君生一儿子延续祖宗香火。我和我的公公都劝过我的夫君纳妾生子，但我夫君信奉天主教，坚决不肯纳妾。可是延续香火不比什么天主教义更重要么，希望陛下能下令逼我夫君纳妾。”
“陛下，臣信奉天主教，按照教义，天主教徒是不能纳妾的。臣在信奉天主教之后得到了陛下的赏识，入朝为官。在臣看来，这正是天主的庇佑。”
“你错了，王徵。朕重用你，是因为你有才学，和天主没有任何关系。你们夫妇二人举案齐眉，一夫一妻相伴度过一生，朕觉得也很好。朕也不想干涉你的信仰，但你也要知道信仰在我大明朝也要入乡随俗，不是必须遵守的铁律。”
“是，陛下，臣还是大明朝的臣子，永远忠于圣上。”王徵跪在地上表忠心。
“天主的事还真是提醒朕了，你发动你的教友，让他们把那些泰西各国冶炼铁炮的技术都学过来，多花点银子不要紧，重要的是把精湛的技艺学过来。”
“是的，陛下，臣立刻着手去办。”
“至于纳妾吗，这是你的家事，朕就不掺和了，你自己看着办吧。”
朱由校说完就留他们夫妻二人在屋子里用餐，皇帝自己回紫禁城里吃午饭。用完午膳，皇帝继续看前线邸报。
目前，在西南战场上，四川巡抚朱燮元统率大军追击奢崇明，乘势收复了四十余座州、县、卫所，包括反贼重兵把守的重庆。
即便如此，奢崇明带着军队退回到山区里头，继续与大明为敌。就现在的战事，朱燮元写了一封长长的奏疏报告情况，和为战死的官吏讨要抚恤。
西南的总体形势是朝廷占上风，皇帝早就下令让延绥总兵官杜文焕率领边军两万下川平敌。孙传庭所率领的一万京军训练有素，器械精良，但毕竟是在外地作战，不熟悉当地山川地形，只有小胜。但即使如此，京军依旧凶悍敢战，士气依旧高昂。
奢崇明现在明显处于下风，四川巡抚朱燮元的裨将刘养鲲跟他汇报说：“有一个叫孔之谭的秀才，来明军大营定约，叛军将领罗乾象想弃暗投明立功赎罪。”
朱燮元便派孔之谭回去，孔之谭回到敌营便劝说罗乾象一同回来。朱燮元把罗象乾叫到大营一同饮酒。罗乾象全身披挂兵甲，腰间悬挂佩刀，朱巡抚对他并不怀疑，与他畅谈一夜。
罗乾象十分感谢朱燮元的信任，发誓以死报答，朱燮元答应了，罗乾象偷偷地回到敌营。此后，叛军中的举动，明军都完全掌握。过了几天，罗乾象将奢崇明引诱到一处密林，朱燮元的伏兵突然出现，叛军大败，奢崇明被打得落荒而逃。罗乾象纵火焚烧敌营，叛军大乱损失过万，罗乾象率领他的部下归顺大明。
天兵再接再厉，继续进攻叛军将领张彤所占领的重庆。当时张彤收集残余士兵上万人，占据重庆的险阻要塞。朱燮元派遣秦良玉夺取二郎关，总兵官杜文焕夺取佛图关。各路将领率领本部人马进逼重庆驻扎，重庆城中粮食不足，朱燮元设计擒获张彤和他的同伙张国用、石永高等三十余人，收复重庆。不久又收复泸州。
在收复重庆、泸州以后，朱燮元给皇帝写了一份长长的奏折，给为国尽忠的臣子们请求抚恤。
这次叛乱，在重庆被反贼杀害的道员有孙好古、骆日升、李继周，知府有章文炳，同知有王世科、熊嗣先，推官有王三宅，参将有万金、王高爵；而段高选一家，其父段汝元，其母刘氏、其侧室徐氏及一子、一女听说叛贼攻入城中都自杀身亡，他的仆人冒着生命危险寻找主人的尸体，也被害。
冲入城中与敌军搏杀，遇到伏兵阵亡的有原任巩昌府同知董尽伦；叛贼攻打成都时陷入敌阵阵亡者有指挥冉世法、雷安世，去援救成都战死者有成都后卫指挥韩应泰，小河所镇抚郁联若。其他在外地方官殉难的有灌县知县左重，他向成都方向追杀叛贼，竭力奋战，战马惊蹶被摔下，痛骂贼军被害；南溪知县王硕辅，县城陷落自杀，叛军将他肢解；桐梓知县洪维翰，县城陷落，同叛贼抢夺官印，不肯屈服，与典史黄启鸣一起被杀；郫县训导赵恺率众杀贼，被刺死；大足县主簿张志誉、典史宋应皋，召集士兵，与敌奋战，气力用尽阵亡。
皇帝看着这份长长的奏章，很受触动。他一直觉得明末有良心，肯为国家出力的士大夫很少。现在看来，也许是因为明末的战乱太多，像这样优秀的官绅死光了，明朝才灭亡的。
对死难者的惋惜没有持续多久，毕竟叛乱还未平息。奢崇明的儿子奢寅被官军抓住，严刑拷打之下，朝廷得知安邦彦也要谋反。安邦彦听说此事败露后，匆忙起兵造反响应奢崇明，自称是罗甸大王。四川没平静，贵州又乱了起来。
安邦彦把持着水西宣慰司，他率兵首先袭击毕节，当地都司杨明廷坚决守城，杀死叛军数百人，最后阵亡，毕节被叛军占领。此时，安邦彦的属下安邦俊、安若山、陈其愚、陈万典等各部头目都蜂拥而起，支援叛乱，他们分兵四路，攻破安顺、沾益，东下瓮安、偏桥一带，而安邦彦亲自统率水西部三万人马渡过陆广河，直1捣贵阳。
明军早已从俘虏的奢寅口中得知安邦彦的野心。孙传庭带着京军星夜兼程赶到贵阳城，接管当地的防御。贵阳城中的布政使、按察使、知府、县令都进京朝觐，巡抚李枟已经解职等待交接，新任巡抚王三善尚未到任。李枟听说发生叛乱，便与巡按御史史永安、提学佥事刘锡元全力协助孙传庭守城，学校教官和秀才们也都组织居民分堞守城。
造反的地方不只是贵州还有云南，乌撒土舍安效良首先归附叛军，便攻破乌撒卫，指挥管良相战死，管良相的同僚李应期、朱云泰、蒋邦俊同时遇害。
了解完目前的战况，朱由校做出自己的部署。该给指示给指示，该给抚恤给抚恤。战争一打起来，朝廷就花钱如流水。