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以智腾长老为首的佛光寺和尚们都被送进大牢，由东厂和锦衣卫共同审问。
这些和尚人多嘴杂，严刑拷打之下，真相你一嘴我一嘴地就吐出来了。五台山的智腾长老在宫廷有熟人，搭着这条关系，他知道皇后是佛教的信徒。由此，智腾心生一计，想出个让惠恩和尚自1焚的毒计。他先是依靠关系找到坤宁宫管事太监曹化淳，将自己的想法传达给皇后。曹化淳收受了五千两银子的贿赂，利用职务告诉了张嫣。
“关系”真是一条奇怪的纽带，任何时期都有这门高深精微、妙不可言的“关系学”。
一切事务调查清楚之后，厂卫准备抓人。大内自然不能随意让这些校尉进出，抓人的职责交给了魏忠贤和他的干儿子李朝钦。
魏忠贤带着十几位年轻力壮的宦官，来到曹化淳的面前，声明要带他去外头问话。曹化淳一听此言，忽然把右肩耸起来贴到右脸颊上来拼命搔痒。
这原是曹化淳在市井里闾时养成的不登大雅之堂的习惯，做大太监后改掉了，但每当惊慌失措时，又会情不自禁地故态复萌。魏忠贤是紫禁城里的老人了，他对曹化淳的这点小细节了如指掌。魏公公心里想道：完了，这人救不回来了。
“来，把曹公公带走。”魏忠贤喊道。
曹化淳就被宦官们押到大牢里，跟和尚们一同被审问。
罪犯们暂且不论，皇后张嫣在乾清宫里向皇帝下跪赔罪。
“宝珠，你可知罪吗？”天子低沉而威严有力的声音打破了尴尬的寂静。
“臣妾知罪。本朝祖宗家法甚严，不准后妃干预宫外之事。臣妾因为信佛，误交佛门败类，险些害死人命铸成大错。请皇上发落！”张嫣一边说着，眼泪就“吧嗒”地一滴一滴落下。
看见张嫣的认错态度好，皇帝语气和缓道：“皇后贵为天下母，更应该以慈爱之心待人，怎么诡异的佛门‘盛事’，你为何就看不明白，还是宝珠你的心田出了问题！”
“皇上，请给臣妾一个机会，让我痛改前非吧，皇上，呜呜——”张嫣真是被吓到了。
正当朱由校要回话时，刘若愚从殿外走进来，行完礼说道：“万岁爷，顺妃娘娘说有关于此案的急事禀告。”
“顺妃有急事，宝珠你先起来。”朱由校用手一指旁边的杌凳，“你到这里坐好。”随后，皇帝跟刘公公吩咐道：“你传顺妃进来吧！”
也许是皇帝宠爱的缘故，也许是因为她是蒙古来的女子，反正张嫣总是提防着海兰珠。
海兰珠身披一件织锦点翠羽缎外衣走了进来，生完孩子的她，体态更加丰满妖娆，相比其他的妃嫔，身形可用浑圆二字形容。
“臣妾给皇上，皇后娘娘行礼了。”海兰珠按照宫廷礼节一丝不苟地行礼。
“顺妃起来吧，有何事要告知朕吗？”朱由校问道。
“在几天前，有一位叫刘娟的宫女，她为此次佛事刺血写了一本《金刚经》，得到了皇后娘娘的奖赏。”
“朕知道，怎么了？”
“这都人刘娟就是那被逼自1焚的惠恩和尚的亲妹妹啊！”
“啊——竟然还有这么巧的事？”
“回皇上，千真万确，臣妾不敢撒谎。”
对话间，海兰珠一直盯着皇上讲话，看都没看皇后一眼。
皇帝微微一笑道：“看来这家人真是有福气，刘恩被朕救了，刘恩他爹被沈将军救了，刘恩他妹妹被爱妃你救了。好吧，就让他们团聚吧！”
“皇上之心大慈大悲，真是活佛。”海兰珠称赞道。
普通百姓人家养了儿子，巴望他读书做官出将入相，生了女儿，却没有几个父母愿意把她送进皇宫。偌大一座紫禁城数千宫女，幸运者只是极少数，大多数宫女的命运都非常凄惨。青丝红颜灿烂如花的少女一旦走进红墙碧瓦的皇宫深院，从此就暌违永隔亲情难觅，哪怕熬到白发鸡肤老态龙钟，也绝不可能离开宫门一步。
因此让刘娟出宫，这的确是特别大的恩典。被智腾长老毒哑了的刘恩在喻嘉言的治疗下，渐渐痊愈了。幸好毒药被锦衣卫查出来了。喻嘉言知道病是怎么来的，能对症下药。
刘家人聚在一起，纷纷流出了喜悦的眼泪，感恩皇上的厚德。曹化淳、智腾长老等罪犯的家产被抄没，十天以后，要在西市集体处斩。
皇帝为此还特地发圣旨给各省各州县的官员们，要他们严查寺庙、道观的犯罪行为。如有作奸犯科者，立即上报京城。
至于皇后吗，朱由校对张嫣毕竟还是有感情的，她生的大皇子，对大明王朝来书，也意味着希望和未来。皇帝不会废后，也没有施加别的惩罚。
不光如此，皇帝还允许张嫣每日花两个时辰亲自抚养儿子。这是不符合规矩的事，以前的皇子普遍是乳娘抚养长大的。张嫣熟知宫廷典籍，得此消息真可谓欣喜若狂。皇后并不是例外，海兰珠也有此待遇。
喻嘉言在治愈了无数病人之后，皇帝认可了他的能力让他担任大明医学院的院长。
得到了皇帝的重用，喻嘉言很高兴，同时也觉得肩上的责任重大。他在京城行医这几年，经历了许多与庸医打交道的过程，也经常纳闷，怎么这些人总是出错。
正好医学院给了喻嘉言一个机会，让他能帮助别的大夫提高医学水平。首先，是把他的弟子集中到一起。
面对第一届的医学生，喻嘉言提出每次给人看病之前，要先议病后用药。
先议病，就是在诊完了脉以后，先不着急给病人开药，要先仔细思考，然后把病讲清楚，这个病是什么原因得的，病人的体质是什么样的，如何治疗，用的什么方法、什么药，药效怎样。这些都要跟病人及家属说清楚，然后再给病人下方子开药，经过这样仔细的思考，就会少走弯路。
这么做还不够完备，大夫还要写下一个议病式。议病式就是中医历史上第一个完备的病历格式。
接诊一个病人，要先写下接诊的年月日和地点，还要记录病人的年龄、体形、肤色、皮肤的枯燥或者润泽、说话声音的清浊、说话声音的长短、情绪如何、什么时候发病的、服用药物的历史、以前服药的效果、病情白天重还是晚上重、身上寒热如何、饮食如何、大小便如何，等等。
在穿越者看来，这个病历格式非常先进。比如说，关于病人说话声音状态的记录就很科学。说话声音的确是诊断的一个重要信息来源。
写下月份，那是要记录春夏秋冬四季对患者发病的影响。记录地点也是类似的道理。
开方子之前还要写下用的是什么方子，根据什么组成方子，方子中的药都是什么性味的，要用来做什么，什么时候能够见效，什么时候能够痊愈，都要事先写下来。
这个规定可以说是极其严格了，应当说大部分大夫都做不到这一点。但朱由校是要百分百支持喻嘉言的规定执行下去。
这个时代的医学说到底是依靠经验治病的，如果每个大夫的行医经验能够汇总到一起。那必然是巨大的进步，可以筛选有效的处方。
朱由校亲自拨款，在外城寻一处地方建了一家大医院。光是建医院还不够，朱由校还要想办法推动外科手术的发展，他公开宣称送到医学院解剖的尸体，可以给家属一些赏钱。解剖研究之后，要请道士为尸体作法。这件事引起了轩然大波，许多朝臣上疏反对，但皇帝意志坚定，坚决推行。
数理院今年也有新发明，他们研究光学的小组，发明了探照灯。原理就是以凹面镜放大光源，作为反光镜，使光源向一个方向反射。
除了探照灯以外，数理院还发明了简易的显微镜、放大镜和近视、远视眼镜。
负责机械制造的副院长王徴则是向皇帝献上了自行车。这是一辆双轮小车，长约三尺，可以坐一人，不用推动就可以自行。一天能跑八十里路。
皇帝看着目瞪口呆，亲自上去骑了一番，的确好用。只是目前这门技术还实现不了生产线大规模制造。朱由校最后重奖了这些为天下做科学研究的人才，发了五万两白银作为奖励。
时间过得很快，到了天启十年的春节，刚刚下过一场雪，万岁山的峰峦上白雪皑皑。
皇帝与众嫔妃玩一种新的冬日游戏——滑雪板。滑雪板有四尺半长，一尺半阔，上端翘起，中间有一根撑木，木上置有划竿，中后部设有骑木。从事滑雪者，跨在骑木上，推动划竿，滑雪板就会前进，滑行速度不断增加。但是，这种滑雪板不易在速行中保持平衡，稍微不慎，就会翻侧摔倒。
朱由校是在西苑的太液池上玩此游戏，湖水被冻得极为硬实。大家的欢声笑语驱散了严寒的天气。